تشخیص تفریقی از جمله مهمترین ابزارها در تشخیص صحیح مشکل یا بیماری حیوان است. به این جهت در ذیل مهمترین علائم و تشخیص های احتمالی تقدیم می گردد.
۱) از دست رفتن اشتها : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، سوء هاضمه و اختلال در جذب مواد غذایی ، کتوزیس ، لیستریوزیس ، ورم پستان ، توکسمی آبستنی ، بیماریهای تنفسی
۲) سقط جنین : بر اثر غیرطبیعی بودن رشد جنین ، عوامل عفونی شامل : بروسلوزیس ، کمپیلوباکتر ، کلامیدیا ، لپتوسپیروزیس ، نئوسپوروزیس ، تب Q ، سارکوسیستوزیس ، تب کنه ای ، توکسوپلاسموزیس عدم کفایت جفت بر اثر چند قلو بودن و عوامل ناشی از استرس و تروما
۳) آبسه ها : لنفادنیت کازئوز ، عوامل عفونی
۴) قوسی شدن پشت حیوان : درد و کولیک
۵) سفتی پاهای عقبی و عدم توانایی استفاده حیوان از آنها : بیماری عضله سفید
۶) نابینایی : کلامیدیا ، پولیوانسفالومالاسی ، زخم چشم
۷) تاول : تب برفکی ، زخم دهان
۸) نفخ : اسیدوزیس ، نفخ
۹) کشیدن بدن و باز گذاشتن پاها : کولیک ، سنگ های ادراری
۱۰) سختی یا افزایش تعداد تنفس : اسیدوزیس ، مشکلات ریوی
۱۱) تشنج : کزاز
۱۲) سرفه های مزمن : CAE (Caprine Arthritis Encephalitis Virus) ، کرم های ریوی ، مشکلات ریوی
۱۳) ناله و فریاد زدن : کولیک ، ورم پستان ، سنگ های ادراری ، بیماری عضله سفید
۱۴) افسردگی : اسیدوزیس ، انتروتوکسمیا ، Floppy Kid Syndrome ، لیستریوزیس ، مشکلات ریوی ، پولیوانسفالومالاسی ، کزاز
۱۵) اسهال : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، کرمهای گرد معدی روده ای ، بیماری یون ، پولیوانسفالومالاسی ، کمبود عناصر معدنی
۱۶) اختلال رفتاری گنگ : اسیدوزیس ، انتروتوکسمیا ، لیستریوزیس ، پولیوانسفالومالاسی ، کزاز
۱۷) تب : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، عفونت ، لیستریوزیس ، پولیوانسفالومالاسی ، مشکلات ریوی
۱۸) کف در دهان : نفخ
۱۹) ریزش مو : مشکلات قارچی پوست
۲۰) خارش : شپش ، جرب ، کنه
۲۱) لنگش : CAE ، آرتریت دژنراتیو ، تب برفکی ، گندیدگی سم ، جسم خارجی در سم ، شکستگی و آسیب مفصل یا بافت نرم ، توکسمی آبستنی و …
۲۲) فلجی پاها : کزاز ، کمبود عناصر معدنی ، بیماری عضله سفید
۲۳) ریزش شدید بزاق : تب برفکی ، لیستریوزیس ، مسمومیت با مایکوتوکسین ها
۲۴) مرگ ناگهانی : بیماری عضله سفید ، انتروتوکسمی
۲۵) کاهش وزن : CAE ، کوکسیدیوزیس ، کرمهای گرد معدی روده ای ، بیماری یون